Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms