Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms