Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TgfbiP82198 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TgfbiP82198 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms