Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx1P81068 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx1P81068 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx1P81068 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx1P81068 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx1P81068 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.2 ms