Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tp53bp1P70399 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tp53bp1P70399 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms