Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad50P70388 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad50P70388 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad50P70388 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad50P70388 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad50P70388 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad50P70388 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad50P70388 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad50P70388 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad50P70388 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad50P70388 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad50P70388 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad50P70388 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms