Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufd1P70362 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms