Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad1P70340 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad1P70340 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad1P70340 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad1P70340 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad1P70340 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smad1P70340 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smad1P70340 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Smad1P70340 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smad1P70340 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smad1P70340 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad1P70340 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms