Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad54lP70270 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rad54lP70270 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms