Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf6P70196 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf6P70196 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf6P70196 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf6P70196 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf6P70196 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf6P70196 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf6P70196 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf6P70196 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf6P70196 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.3 ms