Protein–RNA interactions for Protein: P70190

Capza3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza3P70190 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capza3P70190 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capza3P70190 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capza3P70190 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capza3P70190 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capza3P70190 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Capza3P70190 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capza3P70190 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capza3P70190 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capza3P70190 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capza3P70190 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Capza3P70190 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capza3P70190 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capza3P70190 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms