Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps17P63276 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps17P63276 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps17P63276 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps17P63276 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps17P63276 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps17P63276 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps17P63276 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps17P63276 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps17P63276 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms