Protein–RNA interactions for Protein: P63260

Actg1, Actin, cytoplasmic 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg1P63260 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Actg1P63260 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actg1P63260 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actg1P63260 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actg1P63260 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actg1P63260 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actg1P63260 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Actg1P63260 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actg1P63260 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms