Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ElobP62869 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ElobP62869 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ElobP62869 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ElobP62869 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ElobP62869 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ElobP62869 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ElobP62869 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ElobP62869 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ElobP62869 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ElobP62869 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ElobP62869 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ElobP62869 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ElobP62869 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ElobP62869 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ElobP62869 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ElobP62869 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ElobP62869 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ElobP62869 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ElobP62869 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ElobP62869 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ElobP62869 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ElobP62869 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ElobP62869 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ElobP62869 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ElobP62869 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ElobP62869 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ElobP62869 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ElobP62869 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ElobP62869 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ElobP62869 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ElobP62869 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ElobP62869 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ElobP62869 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ElobP62869 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ElobP62869 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ElobP62869 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ElobP62869 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ElobP62869 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ElobP62869 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ElobP62869 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ElobP62869 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ElobP62869 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ElobP62869 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ElobP62869 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ElobP62869 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ElobP62869 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ElobP62869 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ElobP62869 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ElobP62869 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ElobP62869 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ElobP62869 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ElobP62869 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ElobP62869 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ElobP62869 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ElobP62869 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ElobP62869 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ElobP62869 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ElobP62869 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ElobP62869 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ElobP62869 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ElobP62869 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ElobP62869 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ElobP62869 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ElobP62869 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ElobP62869 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ElobP62869 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ElobP62869 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ElobP62869 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ElobP62869 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ElobP62869 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ElobP62869 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ElobP62869 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ElobP62869 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ElobP62869 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ElobP62869 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ElobP62869 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ElobP62869 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ElobP62869 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ElobP62869 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ElobP62869 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ElobP62869 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ElobP62869 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ElobP62869 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ElobP62869 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ElobP62869 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ElobP62869 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ElobP62869 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ElobP62869 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ElobP62869 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ElobP62869 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ElobP62869 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ElobP62869 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ElobP62869 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ElobP62869 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ElobP62869 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ElobP62869 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ElobP62869 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ElobP62869 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ElobP62869 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms