Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps28P62858 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rps28P62858 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps28P62858 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps28P62858 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps28P62858 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rps28P62858 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rps28P62858 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms