Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms