Protein–RNA interactions for Protein: P62702

Rps4x, 40S ribosomal protein S4, X isoform, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps4xP62702 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps4xP62702 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps4xP62702 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps4xP62702 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps4xP62702 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps4xP62702 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps4xP62702 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps4xP62702 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps4xP62702 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps4xP62702 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps4xP62702 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps4xP62702 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps4xP62702 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps4xP62702 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps4xP62702 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps4xP62702 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps4xP62702 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps4xP62702 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps4xP62702 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps4xP62702 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps4xP62702 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps4xP62702 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps4xP62702 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps4xP62702 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps4xP62702 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps4xP62702 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps4xP62702 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps4xP62702 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps4xP62702 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps4xP62702 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps4xP62702 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps4xP62702 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms