Protein–RNA interactions for Protein: P62313

Lsm6, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm6P62313 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm6P62313 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm6P62313 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms