Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps29P62274 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps29P62274 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps29P62274 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps29P62274 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Rps29P62274 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps29P62274 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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