Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrch1P62046 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms