Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms