Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copz1P61924 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Copz1P61924 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copz1P61924 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copz1P61924 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copz1P61924 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copz1P61924 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copz1P61924 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copz1P61924 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copz1P61924 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copz1P61924 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copz1P61924 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms