Protein–RNA interactions for Protein: P61164

Actr1a, Alpha-centractin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr1aP61164 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms