Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcmtd1P59913 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms