Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms