Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pcif1P59114 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms