Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Senp1P59110 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Senp1P59110 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Senp1P59110 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Senp1P59110 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Senp1P59110 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Senp1P59110 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Senp1P59110 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms