Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rhbdl3P58873 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms