Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms