Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Paxbp1P58501 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms