Protein–RNA interactions for Protein: P56873

Sssca1, Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sssca1P56873 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sssca1P56873 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms