Protein–RNA interactions for Protein: P56542

Dnase2, Deoxyribonuclease-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnase2P56542 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnase2P56542 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms