Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf5P56477 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf5P56477 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf5P56477 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf5P56477 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf5P56477 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf5P56477 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf5P56477 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf5P56477 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf5P56477 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf5P56477 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms