Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcd3P55096 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcd3P55096 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcd3P55096 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcd3P55096 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcd3P55096 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcd3P55096 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcd3P55096 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcd3P55096 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcd3P55096 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd3P55096 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd3P55096 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd3P55096 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd3P55096 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd3P55096 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd3P55096 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd3P55096 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd3P55096 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd3P55096 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd3P55096 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd3P55096 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd3P55096 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd3P55096 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd3P55096 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd3P55096 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd3P55096 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd3P55096 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd3P55096 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd3P55096 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd3P55096 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd3P55096 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd3P55096 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd3P55096 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd3P55096 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd3P55096 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Abcd3P55096 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd3P55096 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms