Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Aqp4P55088 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms