Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cacnb3P54285 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacnb3P54285 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms