Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cux1P53564 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cux1P53564 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cux1P53564 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cux1P53564 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cux1P53564 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cux1P53564 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cux1P53564 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cux1P53564 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cux1P53564 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Cux1P53564 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cux1P53564 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cux1P53564 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cux1P53564 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cux1P53564 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cux1P53564 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cux1P53564 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cux1P53564 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cux1P53564 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Cux1P53564 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cux1P53564 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cux1P53564 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cux1P53564 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cux1P53564 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cux1P53564 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cux1P53564 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Cux1P53564 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cux1P53564 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cux1P53564 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cux1P53564 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Cux1P53564 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cux1P53564 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cux1P53564 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cux1P53564 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cux1P53564 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cux1P53564 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Cux1P53564 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cux1P53564 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Cux1P53564 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cux1P53564 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cux1P53564 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Cux1P53564 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cux1P53564 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cux1P53564 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cux1P53564 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms