Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClgnP52194 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClgnP52194 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ClgnP52194 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ClgnP52194 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ClgnP52194 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ClgnP52194 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ClgnP52194 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ClgnP52194 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms