Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr4P51680 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms