Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc4P51655 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpc4P51655 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms