Protein–RNA interactions for Protein: P50592

Tnfsf10, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 10, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf10P50592 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfsf10P50592 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf10P50592 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf10P50592 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf10P50592 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf10P50592 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf10P50592 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf10P50592 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf10P50592 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf10P50592 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf10P50592 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf10P50592 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf10P50592 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf10P50592 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf10P50592 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf10P50592 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf10P50592 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf10P50592 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf10P50592 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf10P50592 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf10P50592 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf10P50592 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf10P50592 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf10P50592 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms