Protein–RNA interactions for Protein: P50283

Cd7, T-cell antigen CD7, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd7P50283 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd7P50283 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd7P50283 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd7P50283 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd7P50283 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd7P50283 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd7P50283 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd7P50283 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd7P50283 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms