Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cav1P49817 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cav1P49817 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cav1P49817 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cav1P49817 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cav1P49817 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cav1P49817 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cav1P49817 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cav1P49817 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cav1P49817 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cav1P49817 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms