Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnni3P48787 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms