Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prox1P48437 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prox1P48437 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prox1P48437 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prox1P48437 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prox1P48437 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prox1P48437 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prox1P48437 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prox1P48437 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms