Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx1P48377 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms