Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VdrP48281 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VdrP48281 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VdrP48281 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VdrP48281 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VdrP48281 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VdrP48281 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VdrP48281 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VdrP48281 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VdrP48281 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VdrP48281 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VdrP48281 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VdrP48281 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VdrP48281 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VdrP48281 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VdrP48281 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VdrP48281 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VdrP48281 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VdrP48281 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VdrP48281 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VdrP48281 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VdrP48281 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VdrP48281 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VdrP48281 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VdrP48281 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VdrP48281 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VdrP48281 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VdrP48281 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VdrP48281 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VdrP48281 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VdrP48281 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VdrP48281 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VdrP48281 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VdrP48281 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VdrP48281 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VdrP48281 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VdrP48281 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VdrP48281 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VdrP48281 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VdrP48281 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VdrP48281 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VdrP48281 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VdrP48281 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VdrP48281 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VdrP48281 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VdrP48281 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VdrP48281 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VdrP48281 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VdrP48281 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VdrP48281 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VdrP48281 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VdrP48281 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VdrP48281 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VdrP48281 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VdrP48281 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VdrP48281 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VdrP48281 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VdrP48281 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VdrP48281 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VdrP48281 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VdrP48281 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VdrP48281 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VdrP48281 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VdrP48281 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VdrP48281 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VdrP48281 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VdrP48281 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VdrP48281 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VdrP48281 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VdrP48281 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VdrP48281 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VdrP48281 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VdrP48281 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VdrP48281 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VdrP48281 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
VdrP48281 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
VdrP48281 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VdrP48281 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VdrP48281 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VdrP48281 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VdrP48281 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VdrP48281 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VdrP48281 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VdrP48281 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VdrP48281 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VdrP48281 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VdrP48281 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VdrP48281 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VdrP48281 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VdrP48281 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VdrP48281 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VdrP48281 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VdrP48281 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VdrP48281 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VdrP48281 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VdrP48281 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VdrP48281 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VdrP48281 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VdrP48281 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VdrP48281 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms