Protein–RNA interactions for Protein: P47968

Rpia, Ribose-5-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpiaP47968 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpiaP47968 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RpiaP47968 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RpiaP47968 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RpiaP47968 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RpiaP47968 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RpiaP47968 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RpiaP47968 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RpiaP47968 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RpiaP47968 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms