Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syt1P46096 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syt1P46096 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syt1P46096 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Syt1P46096 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syt1P46096 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syt1P46096 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms