Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ItgavP43406 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ItgavP43406 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ItgavP43406 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgavP43406 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgavP43406 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgavP43406 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ItgavP43406 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ItgavP43406 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms